滚动:我国建成世界首个水稻基因索引数据库

2023-04-13 21:46:58 | 来源:科技日报


【资料图】

科技日报武汉4月12日电 (蒋朝常 记者吴纯新)记者12日从华中农业大学获悉,该校张建伟教授课题组联合国内外高校与科研团队,以代表亚洲稻群体结构的高质量基因组为对象,构建并全面分析基因组倒位图谱,建成了世界上首个基于同源基因簇的水稻泛基因组综合数据库——水稻基因索引数据库。相关研究成果发表在《自然·通讯》与《分子植物》。

亚洲栽培稻是世界一半人口的主食。预计2060年至2070年,世界人口数量将增加到约100亿,科研人员迫切需要培育产量高、营养丰富、绿色环保和气候适应性更强的新品种。

张建伟介绍,全球有约500万份水稻种质及其野生近缘种,这些资源的基因组变异中(单核苷酸多态性、插入缺失、倒位和易位等)蕴藏着品种改良的重要信息,对其开展基于泛基因组的多组学研究具有重要意义。

水稻基因索引数据库可为每个水稻基因建立一张“综合图文信息卡片”,实现不同功能和常用数据库之间的快速链接,记录包括OGI、基因通用名、序列、功能、表达等基本信息,并以可交互示意图展示该基因转录本结构、可变剪接事件、同源关系网络图和系统发育树等。

该平台能为用户提供丰富的模块和工具,方便研究人员对不同种质基因以及基因同源关系进行查询、分析和可视化,为全球水稻研究学者提供免费在线检索和分析服务。研究人员可以通过关键词、序列、同源关系等3种方式在数据库中进行搜索,并在微观和宏观尺度对种质间基因组共线性进行分析和可视化研究。

责编:张靖雯

上一篇 下一篇

相关新闻

滚动:我国建成世界首个水稻基因索引数据库

怎么彻底注销闲鱼账号(怎样彻底注销闲鱼账号)|微速讯

环球关注:吉林省“服务企业月”新闻发布会直播预告

探索民间收藏向公众服务转变 北京在行动-即时看

第六届全国青少年人工智能创新挑战赛全面启动

2023年苏州市科技发展计划(第一批)项目指南来了_全球要闻

频繁挖鼻孔或增加患病风险-全球快讯

欧足联收到2028和2032年欧锦赛申办申请

要闻:2023年4月13日甲苯国内市场动态

苹果将iPhone在印度的产量提高两倍至70亿美元 速读

尼日利亚一幢七层在建楼房倒塌 多人被困 焦点热门

环球视点!中青报调查:88.3%受访青年表示喜欢自由度高的工作

江苏银行南京分行承销发行全省首单知识产权资产支持票据 全球百事通

读《拿破仑传》有感600字 记《赤壁赋》读后感600字

当日快讯:产业资本加速布局,回购增持大潮再起-天天亮点

最新新闻

滚动:我国建成世界首个水稻基因索引数据库

怎么彻底注销闲鱼账号(怎样彻底注销闲鱼账号)|微速讯

环球关注:吉林省“服务企业月”新闻发布会直播预告

探索民间收藏向公众服务转变 北京在行动-即时看

第六届全国青少年人工智能创新挑战赛全面启动

2023年苏州市科技发展计划(第一批)项目指南来了_全球要闻

频繁挖鼻孔或增加患病风险-全球快讯

欧足联收到2028和2032年欧锦赛申办申请

要闻:2023年4月13日甲苯国内市场动态

苹果将iPhone在印度的产量提高两倍至70亿美元 速读

尼日利亚一幢七层在建楼房倒塌 多人被困 焦点热门

环球视点!中青报调查:88.3%受访青年表示喜欢自由度高的工作

江苏银行南京分行承销发行全省首单知识产权资产支持票据 全球百事通

读《拿破仑传》有感600字 记《赤壁赋》读后感600字

当日快讯:产业资本加速布局,回购增持大潮再起-天天亮点

关于新增西安银行为万家颐德一年持有期混合型证券投资基销售机构的公告

世界讯息:非法采矿怎么判刑

8岁幼童被狗抓伤狗当天死亡,20天后幼童随之而去,狂犬病多危险|聚看点

新车造型遭“网暴”,车企CEO怒怼网友:跪太久,要不得!_焦点消息

假面骑士decade2021剧场版_假面骑士decade剧场版全集

【环球快播报】常德高新区7家企业入围全国创新积分500强企业

红枣银耳汤怎么熬?_微动态

除了康乃馨还可以送母亲什么花

本科专业大调整!90所大学撤销“公共事业管理专业”

缅甸还有一个被忽视的世界级珍宝,今年行情令人担忧

赶超上海、秒杀深圳!西部第一“楼市巨兽”是如何炼成的|全球快看

每日热门:信用卡逾期多久会被起诉?信用卡逾期被起诉会坐牢吗?

同比增长86%!湖北一季度科技型中小企业突破1.2万家 今热点

突发!知名果链分析师“一句话”,声学巨头立马闪崩_全球视点

首艘国产大型邮轮将推出全新艺术歌舞剧《马可·波罗-丝路情缘》